Vi khuẩn là những sinh vật nhân sơ, đơn bào
Vi trùng là tên gọi chung của những sinh vật có kích thước hiển vi, bao gồm vi khuẩn, động vật nguyên sinh, thực vật nguyên sinh. Như vậy từ "vi trùng" chủ yếu là do cách gọi khác của từ "vi khuẩn" do cách dịch nghĩa mà ra.