1. Mỗi loại bệnh nhiễm khuẩn do các vi khuẩn gây bệnh khác nhau, và các vi khuẩn đó khác nhau về hình thái, kích thước, lớp màng bên ngoài, độc tố, cách thức gây độc... và mỗi loại kháng sinh chỉ có thể tác động lên một đặc điểm cụ thể. Do đó với mỗi loại bệnh nhiễm khuẩn người ta lại sử dụng các thuốc kháng sinh khác nhau.
Không chỉ thế, nếu sử dụng sai kháng sinh không những không chữa được bệnh mà có khi còn để lại hậu quả đối với người sử dụng do gây ảnh hưởng xấu đến hệ vi sinh vật trong cơ thể.