Cơ quan sinh dục nam gồm tinh hoàn,mào tinh,ống dẫn tinh,túi tinh, tuyến tiền liệt,tuyến hành,bìu và dương vật.
Tinh trùng được sản sinh trong ống sinh tinh (cuộn khúc trong tinh hoàn) bắt đầu từ tuổi dậy thì chính thức ở nam trong điều kiện nhiệt dộ thấp hơn thân nhiệt trừng [TEX]2^{\circ}[/TEX]C - [TEX]3^{\circ}[/TEX]C.Tinh trùng gồm hai phần đó là một đầu hình chop và một chiếc đuôi dài.Đàu dài khoảng 4 - 5 [TEX]\mu [/TEX]m và rộng 3[TEX]\mu [/TEX]m ở chỗ rộng nhất,trong đó chứa 1 nhân,môt thể đỉnh và thể gốc long roi.Nhân chứa bộ nhiễm sắc thể đơn bộ,là vật chất di truyền của bố,trong đó mang một nhiễm sắc thể giới tính hoặc X hoặc Y;thể đỉnh chứa acrozin-một enzim có tác dụng phá thủng màng trứng để đưa vật chất di truyền trong nhân vào hòa nhập với nhân của trứng khi thụ tinh;thể gốc của roi đuôi nằm sát phần cuối của nhân.Đuôi chia làm ba đoạn : đoạn tiếp với đầu được coi là than,là phần rộng nhất dài khoảng 5 - 9[TEX]\mu [/TEX]m ,trong chưa ti thể-nơi cung cấp năng lượng cho hoạt động của đuôi,giúp tinh trùng vận chuyển để đến gặp trứng thụ tinh.Phần đuôi chính thức dài khoảng 40 - 45 [TEX]\mu [/TEX]mlà cơ quan vận chuyển chủ yếu của tinh trùng,trong chứa một sợi trục dọc theo chiều dài đuôi. Nơi sản xuất tinh trùng chính là tinh hoàn.Nằm phía trên mỗi tinh hoàn là mào tinh,đó là nơi tinh trùng tiếp tục hoàn thiện về cấu tạo.Tinh hoàn nằm trong bìu ở phía ngoài cơ thể tạo điều kiện nhiệt độ thích hợp cho sự sản sinh tinh trùng.Tinh trùng từ mào tinh hoàn sẽ theo ống dẫn tinh đến chứa tại túi tinh.Ở túi tinh,tinh trùng tiếp tục được nuôi dưỡng nhờ chất dịch giuauf glucoz do thành túi tiết ra.Tinh trùng được túi tinh được hòa vào dịch từ tuyến tiền liệt tiết ra,tạo thành tinh dịch để phóng ra ngoài qua ống *** khi phóng tinh.
Tinh hoàn là một cơ quan sinh tinh trùng đồng thời là tuyến nội tiết (tiết ra nội tiết tố nam testosteron) làm cho cơ thể phát triển giới tính nam.Hình thể ngoài: Có hai hoàn phải và trái nằm trong bìu. Tinh hoàn trung bình có kích thước dài 4,5 cm, rộng 2,5 cm, dày 1,5 cm, cân nặng khoảng 20g. Tinh hoàn được bao bọc bởi một lớp vỏ xơ dày, trắng và không đàn hồi gọi là lớp áo trắng.Hình thể trong: Tinh hoàn được chia thành 300-400 tiểu thùy ngăn cách nhau bởi các vách xuất phát từ mặt trong của lớp áo trắng. Mỗi tiểu thùy có từ 2-4 ống sinh tinh xoắn. Tinh trùng do các ống này sinh ra được đổ vào các ống sinh tinh thẳng, rồi vào lưới tinh hoàn ở phần sau trên của mỗi tinh hoàn. Từ lưới tinh hoàn có 12-15 ống xuất dẫn tinh trùng vào các ống mào tinh. Ở giữa các ống sinh tinh có những nhóm tế bào kẽ tiết ra hormon testosteron.
Mào tinh hoàn uốn cong hình chữ C nằm dọc theo đầu trên và bờ sau tinh hoàn. Mào tinh hoàn có ba phần là đầu, thân và đuôi. Ống dẫn tinh đi từ duôi mào tinh hoàn đến mặt sau bàng quang thì kết hợp với ống tiết của túi tinh để tạo thành ống phóng tinh. Nó dài khoảng 30 cm, đường kính 2–3 mm nhưng lòng ống chỉ rộng khoảng 0,5 mm. Túi tinh, hay tuyến tinh, là một tuyến sản xuất tinh trùng. Nó dài khoảng 5 cm, nằm ở mặt sau bàng quang, dọc bờ dưới của ống dẫn tinh. Đầu dưới của túi tinh mở vào một ống bài xuất ngắn gọi là ống tiết. Ống này kết hợp với ống dẫn tinh cùng bên tạo thành ống phóng tinh. Mỗi ống phóng tinh 2 cm, do ống tinh và ống tiết của túi tinh kết hợp lại tạo thành. Hai ống chạy chếch qua tuyến tiền liệt và đổ vào niệu đạo tiền liệt. Ống mào tinh, ống dẫn tinh, ống phóng tinh và niệu đạo nam hợp thành đường dẫn tinh. Tuyến tiền liệt là một khối hình nón mà đáy ở trên, đỉnh ở dưới. Tuyến rộng 4 cm, cao 3 cm và dày 2,5 cm, nặng trung bình 15-20 g (ở người lớn độ tuổi 30-40); ở sau tuổi 45, tuyến thường to ra. Tuyến tiền liệt nằm ở dưới bàng quang và bao quanh niệu đạo tiền liệt. Dịch tiết của tuyến tiền liệt đóng góp khoảng 60% thể tích tinh dịch và góp phần vào sự vận động và sức sống của tinh trùng. Dịch tiết của tuyến tiền liệt được đổ vào niệu đạo tiền liệt.
Bìu là một túi da rất sẫm màu do các lớp của thành bụng trĩu xuống tạo thành. Nó được chia thành hai lớp ngăn, mỗi ngăn chứa một tinh hoàn và một mào tinh. Trong bìu có lớp có Dartos được tạo nên bởi sợi cơ trơn, sợi đàn hồi và sợi liên kết, tương tự như một cơ bám da.
Dương vật gồm rễ, thân và quy đầu dương vật. Rễ dương vật nằm đáy chậu và dính vào xương mu bởi dây chằng treo dương vật. Thân dương vật hình trụ, có mặt trên hơi dẹt gọi là mu dương vật mặt dưới gọi là mặt niệu đạo. Qui đầu dương vật được bao bọc trong một nếp nửa da nửa niêm mạc có thể di động được gọi là bao qui đầu. Ở đỉnh quy đầu có lỗ niệu đạo ngoài (hay còn gọi là lỗ sáo). Dương vật là cơ quan niệu-sinh dục ngoài vừa để dẫn nước tiểu vừa để phóng tinh dịch.
Thuộc bộ phận sinh dục nam còn có hai tuyến nhỏ nằm hai bên gốc ống *** tiết ra dịch nhờn để bôi trơn làm giảm ma sát trong quan hệ tình dục và dọn đường cho tinh trùng đi qua,đó là tuyến hành( tuyến Côpơ)
Có hai hormon tuyến yên có ảnh hưởng tới cơ quan sinh dục nam là FSH và LH. Hai hormon này có cấu trúc và tên giống như hormon tìm thấy trong cơ thể phụ nữ, và cũng giống như ở phụ nữ, hai hormon này được tiết ra dưới sự ảnh hưởng của LHRH ở vùng dưới đồi. Đối với nam giới, FSH kích thích ống sinh tinh sản sinh ra tinh trùng. LH kích thích những tế bào đặc biệt gọi là tế bào Leydig tiết ra hormon nam testosteron. Bên cạnh tác dụng tạo ra nam tính, testosteron còn kéo theo sự sản sinh tinh trùng.
Số lượng LH tiết ra chịu sự ảnh hưởng của nồng độ testosteron lưu hành trong máu, nếu nồng độ testosteron tụt xuống thì sự tiết LH tăng lên, nhằm đưa nồng độ testosteron trở về bình thường. Sự tiết FSH chịu sự ảnh hưởng của hormon gọi là inhibin. Số lượng inhibin tiết ra được điều phối bởi số lượng tinh trùng tạo ra trong ống sinh tinh. Nếu sự sản sinh tinh trùng giảm, sự tiết inhibin cũng giảm, do đó nồng độ FSH sẽ tăng lên.