Như chúng ta đã biết, phân tử ADN gồm 2 chuỗi polinucleotit song song và ngược chiều với nhau, liên kết với nhau bởi liên kết hidro giữa các bazơ của mỗi chuỗi. Mỗi chuỗi lại được cấu tạo từ các nucleotit liên kết với nhau. Mỗi nucleotit lại được cấu tạo gồm 3 thành phần: đường 5C (đường ribozơ), nhóm phốtphát và nhóm bazơ. Khi 2 nucleotit liên kết với nhau, nhóm Photphat của nucleotit này sẽ liên kết với OH ở vị trí C số 3 của nucleotit kia. Do đó ở 2 nucleotit đầu và cuối của chuỗi polinucleotit sẽ có đặc điểm:
- Nucleotit có nhóm Photphat ở vị trí C số 5 ko liên kết với nhóm OH của nucleotit khác gọi là đầu 5'
- Nucleotit có nhóm OH ở C số 3 ko liên kết với nhóm Photphat của nucleotit khác gọi là đầu 3'
Hình minh họa dưới đây sẽ giúp bạn hiểu rõ hơn: