Trong đất quá trình chuyển hóa nitrogen hữu cơ thành dạng NH4+ cho cây hấp thụ là nhờ vào hệ thống vi sinh vật hóa dị dưỡng trong đất.
Nhóm vi khuẩn sinh amoni hóa sẽ phân giải các protein từ xác chết động vật, mùn bã hữu cơ trong đất để tạo ra amonia (NH3), kết hợp với H+ từ đất để thành amonium (NH4+) và sẽ được cây hấp thụ.