Lợi ích của vi khuẩn:
+ Vi khuẩn có vai trò trong thiên nhiên và trong đời sống con người : chúng phân hủy các chất hữu cơ thành các chất vô cơ để cây sử dụng, do đó bảo đảm được nguồn vật chất trong tự nhiên , vi khuẩn góp phần hình thành than đá dầu lửa . Nhiều vi khuẩn có ích được ứng dụng trong công nghiệp và nông nghiệp.
+ Bên cạnh đó cũng có nhiều loài vi khuẩn có hại:
Gây bệnh cho người, cây trồng gây hiện tượng thối rữa làm hỏng một thức ăn, ô nhiễm môi trường